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苹果短信删除后仍然出现红点，通常表示有未读消息或短信通知。即使已经删除某些短信，但如果有未读消息仍然存在或者有新的短信通知，红点就会继续出现。要消除红点，可以尝试以下方法。
1、检查并阅读所有未读消息。
2、前往“设置”中的“通知”，找到“信息”应用，然后关闭“标记”选项，这样就不会再有新的红点提醒，但这只是关闭了标记提醒，并不代表不会收到通知或信息。
3、如果尝试了以上方法但问题仍然存在，可以尝试重启手机，有时候重启可以解决一些系统的小问题。
如果以上方法都不奏效，建议检查手机是否有其他系统通知或应用通知导致的干扰，如果问题持续存在，可能需要更深入的排查或者咨询苹果官方客服。